El Laboratorio de Análisis de Suelos y Vegetales trabaja en la metodología para la fijación de C en diferentes compartimentos de los ecosistemas, válidos para procesos de certificación de bonos de Carbono. Además de los análisis químicos para determinar estado nutricionales en cultivos tanto en invernadero como en condiciones de campo Este Laboratorio abarca dentro de las  líneas de trabajo la gestión para la sustentabilidad en los agroecosistemas. Para poder mantener la capacidad productiva y alcanzar la sustentabilidad, es necesario  evaluar diferentes  indicadores de calidad de suelo,  entre lo que se encuentran los niveles de nutrientes, contenido de materia orgánica,  pH, infiltración del agua, porosidad, densidad aparente y todos aquellos nuevos indicadores que contribuyan a caracterizar estos sistema, los estudios de ciclos biogeoquímicos de elementos en los ecosistemas: agroecosistemas y ecosistemas naturales y los análisis de parámetros edáficos y  foliares asociados a las concentraciones de nutrientes que inciden en la productividad vegetal.